Темната дупка е най-дългата старопланинска пещера – дължината й е 5300 метра. Отворът й зее отдалеч върху отвесните Лакатнишки скали на 27 метра над Искър. Състои се от две силно разклонени основни галерии, съединени помежду си. Цялата пещерна система е разположена на няколко тежа.
Лакатнишките скали – лица и фигури на великаните са нарисувани на 50 км от София
В сложния лабиринт има многобройни успоредни сухи и водни галерии, зали, площадки, тесни тунели и проходи, пропасти, кладенци, червеникави и кафяви пещерни образувания, водопади, сифони.
Езерата в Темната дупка достигат дълбочина от 3 метра. Най-дълбоко е езерото Пепи – цели 12 метра. При Жековото езеро се появява подземната река, която тече по най-долния пещерен етаж и извира в карстовия извор Житолюб. При поройни дъждове през пукнатините и понорите в пещерата нахлуват мътни потоци и я превръщат в арена на истински водни стихии. Водата запълва етажите, достига до входа на пещерата, излива се навън и стремглаво се спуска към река Искър, като образува живописна водна каскада, пише „Уикенд“.
Пещерата е училище на софийските пещерняци. Направен е неуспешен опит за осветяване на долния етаж, след което кабелите са разграбени. Има врата, която не се заключва.